Un nuevo método para el procesamiento de imágenes va a permitir mejorar la reconstrucción en 3D de las proteínas de los virus, entre ellas la proteína spike del coronavirus. A esta proteína se le consideraba como la llave que necesita el virus para entrar en la célula.
El estudio lo realizaron investigadores de la Universidad Complutense de Madrid, del Centro Nacional de Biotecnología del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC); y de la Universidad Texas en Austin (Estados Unidos). Los resultados aparecieron publicados este martes en la revista Nature Communications.
Los investigadores proponen en su trabajo utilizar nuevos métodos computacionales para procesar las imágenes y mejorar el análisis y la reconstrucción 3D de las macromoléculas biológicas del coronavirus. De esta forma, constataron que conocer la composición de esas macromoléculas es relativamente sencillo, pero no la forma en la que se ordenan en una estructura tridimensional.
La metodología que proponen los investigadores mejora la visualización de las reconstrucciones en tres dimensiones obtenidas mediante crío-microscopía electrónica, así como la calidad de esas imágenes.
“Este trabajo nos permite un entendimiento más amplio de las proteínas y otras macromoléculas que sustentan procesos esenciales para la vida. Proporcionará nuevas herramientas a los biólogos estructurales para interpretar más y de forma más confiable”, explicó el investigador Javier Vargas.
El virus en alta resolución
Estos métodos se aplicaron ya a diversas macromoléculas biológicas con una importante relevancia biomédica y científica. Se incluyó, además, reconstrucciones en 3D de la proteína Spike S del coronavirus.
“Esta proteína es fundamental en la entrada del virus en las células humanas. El procesamiento de esta proteína con estos nuevos métodos permitió analizar regiones que anteriormente no podían interpretarse”, explicó el físico.
El investigador Javier Vargas inició el estudio cuando trabajaba como profesor en la Universidad McGill (Canadá). Lo finalizó a su regreso a la Universidad Complutense de Madrid.
Los investigadores consideran que este trabajo se puede utilizar para mejorar la construcción de modelos atómicos sin información previa de macromoléculas a partir de reconstrucciones 3D.
“Esta información es fundamental para entender y caracterizar las macromoléculas desde un punto de vista bioquímico. También es útil para el diseño de nuevos fármacos; por ejemplo, nuevas drogas para bloquear el acceso del SARS-CoV-2 al interior de las células”, concluyó Vargas.
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